Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A3P48764 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms