Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPOP30536 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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