Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP5DP30049 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms