Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NF1P21359 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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NF1P21359 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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NF1P21359 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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NF1P21359 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NF1P21359 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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NF1P21359 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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NF1P21359 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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NF1P21359 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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NF1P21359 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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NF1P21359 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NF1P21359 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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