Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms