Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCF2P10911 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCF2P10911 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCF2P10911 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCF2P10911 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms