Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SFTPBP07988 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SFTPBP07988 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SFTPBP07988 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SFTPBP07988 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SFTPBP07988 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SFTPBP07988 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SFTPBP07988 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPBP07988 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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