Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX4O95219 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX4O95219 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX4O95219 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX4O95219 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX4O95219 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX4O95219 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX4O95219 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX4O95219 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX4O95219 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX4O95219 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX4O95219 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX4O95219 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX4O95219 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX4O95219 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX4O95219 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX4O95219 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX4O95219 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX4O95219 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX4O95219 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX4O95219 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX4O95219 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX4O95219 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX4O95219 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX4O95219 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX4O95219 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX4O95219 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX4O95219 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 913 ms