Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRMUO75648 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRMUO75648 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms