Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms