Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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