Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EBAG9O00559 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms