Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AP3M1Q9Y2T2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms