Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM2AQ9Y2K7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM2AQ9Y2K7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms