Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms