Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms