Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA13Q9P0J0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms