Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SERINC1Q9NRX5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SERINC1Q9NRX5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms