Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CYP4F12Q9HCS2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms