Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2OQ9C0C9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms