Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms