Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD5Q99717 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms