Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms