Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3L3

TXLNB, Beta-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNBQ8N3L3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXLNBQ8N3L3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms