Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNS3Q68CZ2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms