Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP13-2Q52LG2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms