Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNGA3Q16281 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNGA3Q16281 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms