Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPTX1Q15818 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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