Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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