Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ATRQ13535 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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