Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PRKAA1Q13131 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PRKAA1Q13131 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PRKAA1Q13131 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PRKAA1Q13131 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PRKAA1Q13131 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PRKAA1Q13131 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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