Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
FOXI1Q12951 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXI1Q12951 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms