Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD47Q08722 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CD47Q08722 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CD47Q08722 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CD47Q08722 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD47Q08722 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD47Q08722 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms