Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms