Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCBP3P57721 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms