Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP153P49790 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUP153P49790 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUP153P49790 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP153P49790 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP153P49790 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms