Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRPC1P48995 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms