Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PCP4P48539 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PCP4P48539 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PCP4P48539 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PCP4P48539 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PCP4P48539 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PCP4P48539 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PCP4P48539 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PCP4P48539 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms