Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL9P32969 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL9P32969 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL9P32969 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL9P32969 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL9P32969 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL9P32969 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL9P32969 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms