Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TSPOP30536 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TSPOP30536 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPOP30536 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms