Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CMPK1P30085 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms