Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHC1P29353 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHC1P29353 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHC1P29353 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms