Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPN3P20807 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPN3P20807 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms