Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMNB1P20700 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMNB1P20700 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms