Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF3P18847 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATF3P18847 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATF3P18847 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF3P18847 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF3P18847 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF3P18847 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms