Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA4P13612 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms