Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E2F6O75461 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E2F6O75461 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E2F6O75461 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms