Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNC1O60486 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms