Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCO2O43819 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCO2O43819 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCO2O43819 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCO2O43819 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms