Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BCKDKO14874 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BCKDKO14874 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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